Năm 2007, khi Chân Phật Tông phát triển mạnh tại Malaysia, 6 tổ chức lớn nhất thuộc liên hiệp Phật giáo Malaysia đã có những hành động phản đối kịch liệt và không công nhận Chân Phật Tông.[6] Sau đó Chân Phật Tông đã thành lập Tổng Hội Mật Giáo Malaysia và hoạt động độc lập dưới sự cho phép của pháp luật. Malaysia hiện nay là nơi có nhiều đệ tử của Chân Phật Tông nhất trên thế giới. Năm 2008, Pháp hội Thời Luân Kim Cang tổ chức tại Kuala Lampor thu hút 7 vạn người tới dự và cùng lúc có 1 vạn người xin quy y.

Lư Thắng Ngạn từng gây xôn xao khi vướng vào cuộc điều tra của Ủy ban Nhà nước Bang Washington, khi bị nghi ngờ thông qua quỹ từ thiện rửa tiền vận động cho thống đốc Gary Locke chạy vào Nhà Trắng. Tuy nhiên Locke được chứng minh trong sạch trước ủy ban vào năm 1988. Việc này cũng không ảnh hưởng đến tiền đồ của Locke khi mà sau đó ông ta được giữ chức Bộ trưởng Bộ Thương mại Hoa Kỳ.

Lư Thắng Ngạn cũng từng bị kiện bởi một cựu đệ tử nhập cư người Malaysia với cáo buộc lạm dụng tình dục. Tuy nhiên cáo buộc này không được chấp thuận bởi tòa án hạt King County vì bên nguyên không đưa ra được bằng chứng. Cuối cùng tòa án hạt King County đã tuyên bố chấm dứt vụ kiện.[7] 

Lư Thắng Ngạn tôn thờ Dao Trì Kim Mẫu là một trong 3 bổn tôn lớn nhất của mình (ADiĐà Phật, Địa Tạng Vương Bồ Tát và Dao Trì Kim Mẫu), trong các chùa Lôi Tạng Tự của Chân Phật Tông đều có thờ Dao Trì Kim Mẫu tại chánh điện, bản thân ông cũng truyền dạy và quán đảnh pháp Dao Trì Kim Mẫu như một bổn tôn cho các đệ tử. Điều này cũng gây ra ít nhiều sự phản đối của các tông phái Phật giáo khác, khi họ cho rằng Dao Trì Kim Mẫu là thần linh của Đạo giáo.  

Lư Thắng Ngạn thường tán dương vai trò của các tiểu thần như Thổ Địa, Thành Hoàng cũng như đề cao công dụng thần chú An Thổ Địa Chân Ngôn, dặn các học trò phải có thái độ kính trọng đối với các tiểu thần cho dù đã quy y theo tam bảo Phật Pháp Tăng.  

Ngoài ra trong các cuốn sách của mình, Lư Thắng Ngạn thường kể về những cuộc giao tiếp với Phật Tổ Như Lai, Quan Thế Âm Bồ Tát, Địa Tạng Vương Bồ Tát và nhiều Phật, Bồ tát khác giống như những người bạn thân quen.